Bioanalyste – post doctorant (H/F)
hace 5 días
Plouzané
L’Anses recrute un Bioanalyste – post doctorant (H/F) Poste basé à Plouzané (29 280) • Contrat à durée déterminée de droit public de 18 mois (ou fin au 31/05/2028) - Vos missions Sous l’autorité du Chef de l’Unité Virologie, immunologie et écotoxicologie des poissons et en lien étroit avec nos plateformes NGS et FORTIOR Genetics, vous gérerez le volet transcriptomique d’un projet financé par les Fonds Européen pour les Affaires Maritimes, la Pêche et l'Aquaculture intitulé « Amélioration de la résilience de la filière truite face à l'émergence d'une bactériose en Bretagne, la lactococcose » (projet LactoTruite). Votre équipe L’unité ANSES Virologie, immunologie et écotoxicologie des poissons (VIMEP) est Laboratoire national de référence (LNR) pour les maladies réglementées des poissons et assure à ce titre un certain nombre de missions d’appui scientifique et technique, notamment des activités analytiques en virologie, sérologie et biologie moléculaire (accréditation COFRAC n°1-2251 selon le référentiel ISO 17025). Elle développe en parallèle des activités de recherche sur les agents infectieux, l’impact de polluants anthropiques sur la santé des poissons - en intégrant le développement d’outils d’analytiques et d’approches transversales (utilisation de challenges infectieux pour évaluer l’impact de polluants sur l’immunité par exemple), la mise au point de stratégies de contrôle et de prévention des maladies, ou encore les effets du changement climatique, … ; tout ceci dans une approche One Health. Elle dispose d’installations expérimentales agréées lui permettant de réaliser des essais sur poissons d’eau douce ou de mer en conditions contrôlées, et héberge une plateforme gérée en collaboration avec le Syndicat des sélectionneurs avicoles et aquacoles français (SYSAFF) visant à générer du progrès et des innovations en génétique au profit de la filière aquacole nationale. L’équipe, composée d’une quinzaine de personnes (dont 4 thésards et 1 post-doc) aux compétences multiples et complémentaires, est localisée sur le site IFREMER de Brest (Finistère). Votre quotidien Vous serez en charge du volet « analyse transcriptomique » du projet LACTOTRUITE dont un des objectifs est de déterminer la faisabilité d’une sélection génétique sur la résistance à la Lactoccocose basée sur la robustesse immunitaire individuelle des animaux. En collaboration avec la Responsable de la plateforme FORTIOR Genetics (ingénieure Sysaaf) et de scientifiques évoluant au sein de notre unité et de notre plateforme NGS à Ploufragan, vous mènerez les activités suivantes : Activité 1 : Gérer les échanges avec le prestataire en charge des analyses RNAseq (rétroplanning des opérations, vérification qualité des échantillons, listing détaillé et organisation du transport …) et la récupération des résultats analytiques. Activité 2 : Assurer le post-traitement des données de transcriptomique issues du RNAseq analyser les expressions différentielles en fonction des organes et des conditions expérimentales, définir les processus biologiques modifiés et émettre des hypothèses mécanistiques en intégrant les données de la littérature et en prenant en compte les autres données analytiques disponibles (charges en pathogènes et signes cliniques / mortalités mesurés sur des collatéraux), ceci en lien avec l’Ingénieure Sysaaf présente sur site. Activité 3 : Assurer la mise en forme des résultats et participer activement à leur valorisation (présentations en COPIL, congrès, publications). Activité 4 : En complément, contribuer au bon fonctionnement général de l’unité (gestion des commandes, entretien du matériel, …) et venir en support de collègues – en fonction du plan de charge – sur d’autres projets internes et/ou collaboratifs. Votre profil Formation et expérience requises : • Doctorat d’université en biologie ou équivalent, avec 2 à 5 ans d’expérience dans le domaine de la recherche, idéalement en bioanalyse de données de séquençage., • Un Niveau 1 en expérimentation animale serait un plus. Compétences : • Compétences techniques en post-analyse de données de séquençage, nécessitant la maitrise d’outils informatiques adaptés (type Cytoscape, Rstudio, …)., • Capacités d’analyse, de mise en forme de résultats et de synthèse, • Sens de l’organisation, • Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe, • Autonomie, rigueur et dynamisme, • Curiosité, • Aptitudes pour la communication (congrès, articles), • Compréhension de l’anglais scientifique, • Maîtrise des outils informatiques (pack office) Pour postuler : Contact opérationnel / laboratoire Thierry MORIN, Chef d’Unité VIMEP thierry.morin@anses.fr Adresser au plus tard le 07/08/2026 : lettre de motivation, CV en indiquant la référence 2026-102 à recrutement@anses.fr, L’Anses recrute, accompagne et valorise les talents dans leur diversité pour s’engager au service de la santé publique. Rejoignez-nous !